Metafizyka zajmuje się obszarem rzeczywistości, który znajduje się poza światem fizycznym, jest nieuchwytny dla zmysłów, ale którego istnienie jest uznawane. W myśli islamskiej metafizyka obejmuje takie tematy jak istnienie Boga, dusza, życie pozagrobowe, anioły, dżinny, przeznaczenie i niewidzialny świat. Ta kategoria ma na celu zbadanie, jak koncepcje metafizyczne są traktowane zarówno w ramach islamskich dogmatów, jak i z perspektywy filozoficznej.

Koran chwali tych, którzy wierzą w niewidzialny świat i uznaje wiarę w elementy metafizyczne za jeden z podstawowych warunków bycia wierzącym. Metafizyka to nie tylko wiedza, ale także kwestia wiary. Ta kategoria ma na celu wyjaśnienie takich tematów, jak istota duszy, życie po śmierci, istnienie aniołów i dżinów, opierając się zarówno na źródłach islamskich, jak i na poglądach klasycznych filozofów islamskich (Farabi, Ibn Sina, Ghazali itp.).

Metafizyka pozwala człowiekowi dogłębnie zastanowić się nad celem swojego stworzenia, miejscem w wszechświecie i sensu życia. Z tego powodu wnosi zarówno intelektualną, jak i duchową głębię.