Metafysiikka käsittelee todellisuuden aluetta, joka sijaitsee fyysisen maailman ulkopuolella, jota ei voida havaita aisteilla, mutta jonka olemassaolo hyväksytään. Islamilaisessa ajattelussa metafysiikka sisältää näkymättömään maailmaan liittyviä aiheita, kuten Jumalan olemassaolon, sielun, tuonpuoleisen elämän, enkelit, dzinni-olennot, kohtalon ja salatun tiedon. Tämän kategorian tarkoituksena on tutkia, kuinka metafyysisiä käsitteitä käsitellään sekä islamilaisen uskonopin puitteissa että filosofisesta näkökulmasta.

Koraani ylistää niitä, jotka uskovat näkymättömään, ja pitää uskoa metafyysisiin elementteihin yhtenä uskovaksi tulemisen perusedellytyksistä. Metafysiikka ei ole vain tietoa, vaan myös uskon asia. Tämän kategorian tavoitteena on selittää sielun olemus, kuolemanjälkeinen elämä, enkelien ja dzinni-olentojen olemassaolo sekä islamilaisiin lähteisiin että klassisten islamilaisten filosofien (Farabi, Ibn Sina, Gazali jne.) näkemyksiin perustuen.

Metafysiikka tarjoaa ihmiselle mahdollisuuden kyseenalaistaa syvällisesti luomisen tarkoitusta, paikkaansa universumissa ja elämän tarkoitusta. Tältä osin se tarjoaa sekä älyllistä että henkistä syvyyttä.